Версия по теории русловых названий(ТРН).
Верхние Мандроги, издревле деревня, сейчас туристическое место на реке Свирь, для обслуживания туристических теплоходов.
Названа по реке Мандрога, а река по озеру Мандрогское.
Озеро похоже на "плывущую водяную крысу", современное название этого животного "ондатра".
Слова "ондатра"(ондра) и "мандра" скорее всего одно и тоже, с той разницей, что: самец и самка. Либо "мандра" древнее название животного.
Мандрога- река, озеро в виде "водяной крысы".