1 Изначальные Ab initio методы и гамильтонов подхо

Раздел
Фундаментальные расчет и моделирование материалов
A-1 Изначальные (Ab initio) методы и гамильтонов подход к кластерам, твердым телам и полимерам
A-1: Передовое изначальное (ab initio) МОДЕЛИРОВАНИЕ   примененое к нанотехнологии
Ю. Kawazoe, Х. Mizuseki *, Институт исследований материалов, Университет Тохоку, Сендай, 980-8577, Япония

Становится возможным предсказать, атомные структуры и физико-химические свойства наноразмерных материалов на основе передовых изначальных (ab initio  ) компьютерных моделирований без экспериментальной информации. Мы формулируем и развиваем компьютерный код ТОМБО (Тохоку смешанный базисных орбиталей метод), основанный на многих тел электронного газа теории. Несколько успешных примеров будут представлены показать возможности данного метода предсказать новые кластеры, поверхности, и громады, в том числе кремния фуллеренов, проведение линии порфиринов, водород поглощающих гидрата клатлат (crathlate), и многое другое.

A-1: SL02 Изначальные ИССЛЕДОВАНИЯ дефектов в полупроводниках

Сердар ЕГЮТ, Университет штата Иллинойс в Чикаго, Chicago, IL 60607, США

За последние два десятилетия, ab initio псевдопотенциала расчеты, основанные на суперъячейке и методы реального пространства кластера
оказались очень мощным инструментом для моделирования дефектов в полупроводниках. Об этом говорят, два последних приложения
из этих методов будут представлены в деталях. Во-первых, структурные энергетики Как-Вакансии пар в Si (E-центр дефекта) будут рассмотрены  с использованием метода реального пространства кластера. Это будет показано, что E-центр в различных типов экспонатов Si искажения Яна-Теллера  зависит от зарядового состояния, в согласии с экспериментом. Различные рассчитанные
свойства этого дефекта (Яна-Теллера энергий, переориентация барьеров, сверхтонких параметров) будут представлены и  сравнены с экспериментом. Во-вторых, структурная энергетика вакансии кислорода (VO) в прототипе перовскита
SrTiO3 будет рассмотрена с использованием плоских волн подхода с суперклеткой содержащей до 320 атомов. Такие большие размеры будет показано необходимы для описания этого, казалось бы простого дефекта правильно. Это будет показано, что релаксация моделей и дефекта формация энергий должные к V0 сильно спарены с его антиферродисторсионной (ФАР) фазой, низкотемпературной тетрагональной структурой SrTiO3. Кроме того, расчеты показывают, что V0 уменьшает относительную стабильность фазы AFD над кубической фазой, в соответствии с последними экспериментальными результатами, которые находят снижение AFD- кубической температуры перехода в образцах с более высокими концентрациями V0.
 
A-1: IL03 Вычислительная химическая связь, ИСПОЛЬЗуя топологический подход
Бернард Сильви, Lab. де Chimie th;orique (UMR 7616), Университета Пьера и Мари Кюри, Париж, Франция



Градиент вектора поля Бека и Эджкомба локализации электрона функции ELF - динамическая система,  которая обеспечивает математическую модель теории связи Льюиса, а также модели VSEPR. Это дает возможность выполнить разбиение молекулярного пространства в бассейне аттракторов, которые представляют один к одному соответствие с парой электронов Льюиса или с электронной областью Гиллеспи. Кроме того атомное ядро явно учтено. Есть два основных типа бассейнов аттракторов: ядра и валентный бассейн. Ядерный бассейн окружают нуклоны (за исключением протона) и внутренние ядерные бассейны, когда они существуют. Валентный бассейн характеризуется его синаптическим (synaptic) порядком, который соответствует числу ядерных бассейнов с которым он разделяет общую сепаратрису. Введение концепции синаптического порядка позволяет рассмотреть одинокие пары, бицентрические и полицентрические соединения с уникальным набором критериев. С количественной точки зрения, бассейна свойства рассчитываются путем интегрирования свойств плотности над бассейном томов. Бассейна населения, N, и их дисперсии ;2 являются индикаторами прочности и делокализации. Это математическая модель улучшает определения химических понятий и удаляет расхождения между подходом Льюиса и квантовой механики.

A-1: SL04 Изначальный (Ab initio ) ПРОГНОЗ кластерных структур и Соответствующие Свойства
Leeor Кроник, Департамент Материалов и интерфейсов, Институт Вейцмана, Rehovoth 76100, Израиль

Геометрия стабильных кластеров является одним из их наиболее интересных свойств, потому что все другие свойства кластера (Химические, механические, электрические, оптические, ...) часто сильно структурно-зависимы. К сожалению, кластер структуры, как правило, не поддаются прямому экспериментальному определению. Это может значительно осложнить анализ экспериментальных данных кластера. В этом разговоре, я представлю подробное сравнение между теорией и экспериментом для статической  способности заполнения уровня (poolarizability) кластеров натрия и фотоэлектронные спектры гидрогенизированного анионов кластера кремния. В каждом случае я буду анализировать кластерные структуры и зависимость структуры измеренных свойств. Это позволит пролить свет на равновесия и неравновесных вклады в наблюдаемые явления.

A-1: IL05 БОЛЬШОЙ-шкалы  изначальные (AB-initio) РАСЧЕТы
М. Я. Гиллан *, Р. Чодхури, D.R. Боулер, физики и астрономии департамент, Университетский колледж Лондона, Гауэр улица,
Лондон WC1E 6BT, Великобритания; Т. Миядзаки, Национальный институт материаловедения, 1-2-1 Sengen, Цукуба, Ибараки
305-0047, Япония

Теория функционала плотности (DFT) стала стандартным инструментом моделирования конденсированных сред. Но обычные методы очень неэффективны для больших сложных систем, так как масштаб требования к памяти, как и N2 ,  к процессору требования, как N3 (N-число атомов). В сильной связи теории, есть широко внедрились методы, в которых масштабирование линейное в N, но это оказалось сложно распространить эти методы (DKF) ДПФ. Мы сообщаем, недавний прогресс в развитии кода завоевания (CONQUEST), которое выполняет линейного масштабирования ДПФ. Расчеты на параллельных компьютерах, и продемонстрировали способность управлять системами более 10.000 атомов. Код основан на стратегии минимизации полной энергии по отношению к Кона-Шема матрицы плотности, и практические методы реализации этой стратегии будут обобщены. Практические проблемы обеспечения хорошей параллели производительности будут также изложены. Это будет объяснено, как код может работать на различных уровнях точностью, начиная от ab initio сильной связи, через ab initio сильной связи, к полной ab initio. Иллюстрации будут приведены практическое ДПФ моделирование, осуществленное на системах из нескольких тысяч атомов на поверхности кремния, комплекс деформации управляемой реконструкции Ge / Si поверхности, и оксидных систем. Перспективы будущего большого-масштаба работа по биологическим системам будет набросана.

A-1: IL06 SIESTA МЕТОД для линейной-шкальной плотности (linear-scaling density) теории функционала
Е. Artacho, кафедра наук о Земле, Кембриджский университет, Великобритания; JD Gale *, Институт Нанохимия исследований,
Технологический университет Кертин, PO Box U1987, Перт 6845, Западная Австралия; А. Гарсия, Университет дель Паис
Васко, Бильбао, Испания; Дж. Junquera, Rutgers University, Piscataway, Нью-Джерси, США; П. Ordejon, Институтом Ciencia де
Материалы Барселоны, CSIC, Испания, Д. Санчес-портал, отпр. де-де Fisica Materiales и DIPC, УПВ / ЕГУ,
Donostia, Испания; Дж. М. Солер, отпр. де физиков-де-ла Materia Condensada, Университет Aut;noma де Мадрид, Испания

Подход, отраженный в коде SIESTA будут представлены, демонстрируя, что через слой (lise) строго локализованных псевдо-атомных орбиталей можно достичь линейного масштабирования строительство гамильтониана и перекрытия матриц. В сочетании с построением функций Ванье в решении самосогласованной проблемы, это делает возможным для достижения так называемого порядка N функционала плотности. Особое внимание будет уделено на параллельной реализации алгоритмов, как при выполнении ССП (SCF) с помощью диагонализации & так и с истинного порядка N масштабирования. Примеры применения метода, которые демонстрируют его применимость в области
нанотехнологии будут кратко представлены.
A-1: IL07 Ab initio путь интегральной симуляции в физике конденсированных сред
Доминик Маркс, Lehrstuhl / ° Chemie Theoretische г, Рур-Universit ‰ Бохум т, 44780 Bochum, Германия
Ab initio путь интегралов – генерализация Кар-Паринелло молекулярной динамики, которые позволяют включать ядерные квантовые эффекты, см. обзор [1]. Этот метод позволяет исследовать квантовые явления, такие как
влияние нулевых движений и туннелирование протонов, в «химически сложных» системах. После краткой презентации метода, несколько последних исследований жидкостей, твердых и кластеры будут представлены.
[1] Д. К. Маркс и Дж. Хаттер, в: Современные методы и алгоритмы Квантовой химии Quatum Chemistry;, (ред. J. Grotendorst), с
301-449, NIC, J ° Лич (2000)

A-1: IL08  О теории функционала плотности ДЛЯ РАСЧЕТ ВСЕй ЭНЕРГИИ
Марк ван Schilfgaarde, кафедра Chem. технологии и материаловедения, Аризона государственный университет, Темпе, Аризона, США

Новый вид  самосогласованного GW приближения представлен. Он основан на всех- электронов, полного- потенциала ЛМТО (LMTO) методе. Повторяя собственный GW гамильтониан, самосогласование как плотность заряда и
спектра квазичастиц достигается. Таким образом, этот метод не связан с LDA, хотя на практике LDA используется, чтобы начинать догадываться (guess) для собственной энергии (self-energy) и в строительстве основы присоединенных (augmented-wave) волн множества. Мы объясняем, почему этой форме самосогласования следует отдавать предпочтение перед обычной. Покажем, что во многих случаях (например, ZnO, InN) самосогласование является существенным. Все свойства изучены, в том числе валентной полосы (bandwidths), фундаментальных и выполняемого состояния (excitedstate) пробелов, эффективных масс, и позиций полуядра (semicore) D уровней, как правило, прекрасно согласуется с экспериментом. Маленькие, но систематические ошибки остаются, самая выдающаяся выявляет небольшую тенденцию к завышению Gamma_v-Gamma_c перехода в полупроводниках цинковой марки. Антиферромагнитные оксиды переходных металлов MnO и NiO также представлены. Многие детали электронной структуры точно даны, в том числе валентных группы спектров квазичастиц, фундаментальной запрещенной зоны, и угри (EELS) спектров. Это говорит о том, что квазичастиц Ландау картина MnO и NiO обеспечивает разумное описание электронной структуры даже в этих коррелированных материалах. Переходные металлы Fe, Ni, Co аналогичным хорошо описаны, в том числе магнитные моменты, а положение и ширину D полос.

A-1: SL09 (LDA + DMFT ) ПЛП +ДТЗП подход к материалам с сильными электронными корреляциями
К.,Хелд, MPI для твердых тел научно-исследовательский, Штутгарт, Германия

Обычных зонных расчетов в приближении локальной плотности ПЛП (LDA) весьма успешны для много материалов, но пропустить важные аспекты 01 физики и энергетики 01 сильно коррелированных электронных систем, таких, как оксиды переходных металлов и $ F $-электронных систем отображения, например, Мотта изоляционный и тяжелых квазичастиц поведения. В этой связи, ПЛП + ДТЗП (DMFT) подход, который сливается с ПЛП современный подход многих тел,
динамическая теория значения поля (ДТЗП) оказалась прорывом  вперёд реалистичного моделирования коррелированных материалов. В зависимости от силы электронной корреляции, ПЛП + ДТЗП расчет дает слабо
коррелированные результаты ПЛП, сильно коррелированных металлов, или изолятора Мотта. Этот разговор представляет собой введение в этот
раздел вычислительной техники [1] и представляет результаты для двух оксидов переходных металлов: V203 [2], который испытывает знаменитый переход Мотта-Хаббарда, и Sr (Ca) VO3 [3]. Также обсуждаются последние события в
фотоэмиссии спектроскопии для V203 [4]. Я благодарю, поддержку Эмми Нетер программы DFG и благодарим соавторов ниже для совместных усилий.
[1] К., состоявшемся, I.A. Некрасов, Г. Келлер, В. Eyert, Н. Bluemer, A.K. McMahan, R.T. Scalettar, Т. Pruschke, В.И.
Анисимов, Д. Vollhardt, Реалистичные исследования электронных систем с LDA + DMFT;, пси-К
Информационный бюллетень № 56, 65 (2003) [psi-k.dl.ac.uk/newsletters/News \ _56/Highlight \ _56.pdf].
[2] К., состоявшемся, Г. Келлер, В. Eyert, В.И. Анисимов, Д. Vollhardt, Phys. Ревью письма. 86, 5345 (2001).
[3] I.A. Некрасова и др.. Препринт cond-mat/021150.
[4] S.-K. Mo и др.. Phys. Ревью и письма. 90, 186403 (2003); опубликован.

A-1: SL10 ТОЧНЫе усилия с КВАНТуумом Монте-Карло: первый шаг к QMC-основной ab initio  МОЛЕКУЛЯРНОЙ ДИНАМИКИ
Мишель CAFFAREL *, Роланд Assaraf, и Bhargavi Srinivasan, CNRS-Laboratoire де Chimie th;orique,
Universite Paris VI, дело Курьер 137, 75252 Paris Cedex 05, Франция

В этом докладе мы представляем наши последние предложения (1-2) для вычисления силы используя квантовый Монте-Карло. Метод,  основан на генерализированном нулевой -вариации нулевого- смещения свойстве справедливом для произвольных наблюдаемых (таким образом, генерализированные обычно свойства нулевой-вариаций, связанные с энергией), позволяет вычислить силы с точностью, которая может быть сопоставима с полученным при энергиях. Приложения к простым двухатомным молекулам, а также более реалистичной системы (Кластеров атомов, больших молекул), представлены и возможность развития QMC- основной ab initio молекулярной динамике программы.
(1) Р. Assaraf и М. Caffarel, J. Chem. Phys. 113, 4028 (2000).
(2) Р. Assaraf и М. Caffarel ;;Zero-Разница нулевом смещении принцип для наблюдаемых в квантовой Монте-Карло:
Применение к Forces;; J. Chem. Phys. (Ноябрь 2003 г.).

(2) A-1: SL11 Рассеивание мощности в наномасштаба проводниках: квантовой (Quantum), классической и СМЕШАННой квантовоклассической ДИНАМИКе
Tchavdar Тодоров, Queen;s университета в Белфасте, Великобритания


Вместе с коллегами из Queen`s, UCL и Оксфорд, электрон-фононного взаимодействия и местные рассеивания (dissipation) мощности в токопереносе (current-carring) нанопроводов изучается с использованием трех различных типов динамики: чисто квантовой (Квантовых электронов и квантовых колебаний ионов), чисто классической (классические электронов и классические колебаний) и смешанной (квантовой электронов и классических вибраторов). Нашей конкретной целью является сравнение чисто квантового и смешанного квантово-классического описания электрон-фононного взаимодействия и рассеиваемой мощности, в целях установить, в чем режимы оба согласны и где они не согласны. Мы работаем над этой проблемой как с ручкой и бумагой и численно, используя зависящее- от времени сильной- связи смешанных квантово-классического моделирования токопередачи атомных проводов. Этот доклад будет давать обзор нашего прогресса на сегодняшний день.


A-1: L12 Привлекательный центр U в течение трех- диапазонов модели Хаббарда
Миклош Gulacsi, теоретической физики, Институт перспективных исследований, Австралийского национального университета в Канберре,
ACT 0200, Австралия
Эффективный гамильтониан для трехзонной модели Хаббарда был получен каноническим преобразованием, был рассчитана и суммируется для бесконечного порядка. Преобразованный гамильтониан содержит члены с сильно
перенормированной энергией взаимодействия. Эти новые энергии взаимодействия показывают перемены знака как функция от интеграла перескока в дополнение к сильному снижению разрыва  переноса заряда (charge-transfer) и значительное увеличение в привлекательном кислорода Хаббарда сроке.

А-2  Достижения в области вычислительных многомасштабных
 методов

A-2: IL01 ПРЕОДОЛЕНИЕ  масштабов длин  в полимерных системах
Курт Кремер, Института Макса Планка для полимерных исследований, 55021 Майнц, Германия

В отличие от низкомолекулярных массовых соединений, полимеры имеют огромную внутри-молекулярную энтропию, которая пропорциональна молекулярной массе объекта. Эта энтропия доминирует упаковок шариков друг с другом и общей конформации. Эта часть свободной энергии является общей и качественно одинакова для всех полимеров, ведущих на универсальных статических и динамических свойствах. Она может быть понята на мезоскопическом или `масштабирования ` (scaling) уровня. На микроскопическом, атомистическом энергий масштаба происходящих из химических связей и шарик-шарик взаимодействий доминируют структуры. Эти энергичные взносы существенно отличаются для различных химических видов и  имеют величину также пропорциональную молекулярной массе полимера. Так оба, энергичный и внутри цепочки (intra-chain) энтропийный взносы одинакового порядка. Чтобы понять свойства данного полимера системы количественно, оба аспекта должны быть должным образом приняты во внимание. Можно показать, что грубая сила атомистического моделирования, например, расплава полимера является ни возможным, для почти всех систем интересов, и не очень полезна,  как большинство из порожденной информации не нужна для количества интереса. Лекция дает некоторые примеры попыток систематически соединить моделирования различных масштабов длины и этим  создать хорошо уравновешенные конформации плотных полимерных систем. Для примера поликарбонаты различных модификаций рассматриваются. Объединением
систематическое огрубления зёрен с последующим обратным отображением также большой атомистической системы могут быть уравновешены на компьютере. Это позволяет например, исследования структуры вакансий и проникающую диффузию в полимере матриц. В следующем шаге специфическими взаимодействиями шарик фрагментов с металлической поверхностью изучены сочетанием ab innitio  и крупнозернистого моделирования. Последствия для объемного материала вблизи поверхностей и возможные последствия для технических проблем будут обсуждаться также. Такой же анзац (ansatz) также служит для лучшего понимания различных длин запутанности различных полимеров. По этой ссылке конкретные движения может быть идентифицированы. Несколько других примеров для полимеров в расплавах и решения будут также обсуждены.

A-2: IL02 МОДЕЛИ крупнозернистого ПОЛИМЕРа: развитие и применение
Ф. М ° Меллера-Плат, Международного университета Бремена, PO Box 750 561, D-28725 Бремен, Германия
Крупнозернистый модели полимера вычислительно экономически эффективны и позволят моделирование больших систем для долгого времени. В то же время они сохраняют некоторые конкретные особенности химического вещества из полимера, который в настоящее время моделируется. Мы разработали автоматические вычислительные схемы для поколения крупнозернистой модели
из атомистических справочных данных. Это позволяет прогнозирования крупномасштабных длительного времени (long-time)  свойств полимера, начиная с подробного описания. Кроме того, после повторной установки атомов в полимерные структуры уравновешенные на крупнозернистом уровне, а также атомистические свойства могут быть получены на удовлетворительном уровне. Примеры применения для расплавов полимеров и растворах.

A-2: IL03 трещины и крейзы (crazes): от атомных взаимодействий кМАКРОСКОПИЧЕСКИм АДГЕЗИям
Марк О. Роббинс *, Johns Hopkins University, Baltimore, MD 21218, USA; Йорг Rottler, Принстонский университет,
Princeton, NJ 08544, USA
Крейзы интригуют структуры, которые дают стеклообразные полимеры большая часть их устойчивость к разрушению. Полимеры (~ 0,5 нм в диаметре) сгруппированы в разветвленную сеть ~ 10 нм в диаметре полимеров, который расширяет ~ 10 мм по обе стороне ~ мм трещины. Явления на все эти масштабы должны быть включены, чтобы определить макроскопические энергии разрушения. Мы делаем это путем объединения молекулярной динамики моделирования роста трещин, деформации, и отказ в субмикронных масштабах с сплошных сред (континуума) механики разрушения вычислением для расчета начала распространения трещины. Наши результаты находятся в количественном согласии с безразмерными отношениями, которые описывают экспериментальные полимеры и их изменение с температурой, длину и жесткость полимера. Они также помогают выявить, почему и как трещины  формировались. Анализ локальной геометрии и напряжений предлагает новый взгляд на реальном пространстве природу заграждений, которая контролируют динамику расплава. Крейзы также показывают много общих черт с застрявшей системами
таких как сыпучих среды и пены, но  уникальны в заклинивании под нагрузкой растяжением. Эти позволяют объяснения экспоненциального распределения напряжений в застрявших системах для проверки.
A-2: SL04 Огрубление зёрен полимеров как СОФТ КОЛЛОИДОВ
А.А. Луи, кафедра химии, Кембриджский университет, Великобритания
Смеси коллоидов и полимеры представляют собой классическую проблему в преодолении масштаба длин. Тогда как коллоиды могут быть
моделироваться как отдельные объекты, каждый полимер, как правило, состоит из многих индивидуальных (малый) мономеров. В этой лекции мы обсудим  пути огрубления зёрен полимеров для простых объектов, мягких коллоидов («SOFT colloid») ,  которая может привести к ряду задач магнитуд ускорения при моделировании коллоидно-полимерных смесей. Более важные уроки об использовании эффективных потенциалов также будет обсуждаться.
Список литературы: Phys. Ревью пистма. 85, 2522 (2000), J. Chem. Phys. 114, 4296 (2001); Phys. Ревью письма. 89, 128302 (2002)

A-2: SL05 Пошаговое выполнение (TIMESTEPPERS) и уравнение-свободное ( equation-FREE) моделирование сложных систем: БЛАГОПРИЯТНЫХ МИКРОСКОПИЧЕСКИЙ тренажеров для выполнения системного уровня задач
Яннис Г. Кеврекидис, химическое машиностроение, PACM и математики, Принстонский университет, США
В текущем моделировании, наилучших имеющихся описаний системы часто приходят на тонком уровне (атомистическом, стохастическом,
микроскопическом, индивидуум-ориентированном), а вопросы и задачи, предусмотренные описанием модели (Modeler) (прогнозирование,
параметрический анализ, оптимизация и контроль), находятся в гораздо грубее, усредненном, макроскопическом уровне. Традиционные подходы к моделированию начинают с первого вывода макроскопических уравнений эволюции от микроскопических моделей, и затем обеспечивают наш арсенал математическими и алгоритмическими средствами, чтобы нести  эти макроскопические описания.  За последние несколько лет, и с несколькими сотрудниками, мы разработали и проверили математически вдохновлённое, компьютерная возможная технология, которая позволяет моделеру (modeler) выполнять макроскопические задачи действующие на микроскопических моделях непосредственно. Мы называем это `безуравнения` (`equation-free`) подход, так как он обходит шаг получения точного макроскопического описания. Я буду утверждать, что основой такого подхода является дизайн (вычислительных) экспериментов. В традиционном численном анализе, основной код пингс (`pings`) подпрограммы содержащий модель, и использует обратную информацию (производные по времени, функции оценки, функциональные производные) для выполнения компьютерного анализа. В нашем подходе  сам основной код `пингс` подпрограмма, которая устанавливает краткий ансамбль надлежаще инициализированых вычислительных экспериментов, из которых  сами величины оцениваются (чем переменные присваиваются). Традиционные сплошной среды численные алгоритмы таким образом, можно рассматривать как протоколы для экспериментального проектирования (где `эксперимент` средства вычислительного эксперимента установлены и осуществляются с модели на другой уровень описания). Один из наглядных примеров будет включать в себя движение интерфейса в проблеме с самоорганизующимся перетаскиванием. В конечном счете,  что делает все это возможным, появляется возможность инициализации вычислительных экспериментов по желанию. Короткие всплески надлежаще инициализированных вычислительных экспериментов –через (-through)  без матрицы (matrix-free) численные анализы и инструменты теории систем, как уменьшение вариации и оценка –мосты (estimation- bridges) микроскопического моделирования с макроскопическими моделированием.

A-2: IL06 КВАНТОВая АРХИТЕКТУРА НОВЫЕ ТВЕРДЫЕ тела: 100.000 ATOMов ЛПП (LDA)-КАЧЕСТВО расчетов
Алекс Zunger, Национальная лаборатория возобновляемых источников энергии, Golden, CO 80401, США

Один из вековых открытых вопросов в химии твердого тела, металлургии и физики конденсированных сред является происхождение разнообразия наблюдаемых кристаллических структур. Простой факт, что даже ограниченные сами  материалами, сделаны только из двух элементов (например, Cu-Au или Si-Ge), и  субституциями (формами) системы, может существовать столько, сколько 2N возможных кристаллических структур. Действительно, даже для небольшого числа сайтов N, это астрономическое число. Какие из них являются наиболее стабильными? Этот доклад излагает подход к решению. В нем рассматриваются вопросы: (I) нахождения наименьшей энергии конфигурации любой данной системы А-В; (II) расчет их состава-температуры фазовая диаграмма, а также, (III) их конечная температура термодинамические свойства, используя первые принципы локальной плотности приближения ЛПП (LDA) в рамках «Линейного расширения  в геометрических объектах ЛРГО» (LEGO) подхода. Я проиллюстрирую метод для полупроводниковых систем и систем переходных металлов интерметаллидов, показывая, как ранее неожиданных конструкций и материалов по прогнозам предсказываются. Затем я рассмотрю идея «Инверсной зонной структуры»,  то есть, найти кристалла конфигурацию, которая имеет желаемую электронную зонную структуру.

A-2: SL07 Внутренняя оптимизация геометрии координат и линейного масштабирования ab initio ТЕОРИЯ для квантовой БИОХИМИи
М. Чаллакомб и К. Немет *, теоретического отдела, MS B268, Лос-Аламосской национальной лаборатории, 87545, США
Хотя развитие линейных методов масштабирования для AB initio  квантовой химии было успешно, проблема решения для больших систем  затруднено из-за отсутствия аналогично эффективных алгоритмов для оптимизации и свойства оценки. В этом докладе линейного масштаба квантовая химия будет рассмотрена, и новый метод внутренних координатной геометрии оптимизации больших систем будут описаны. Этот новый алгоритм достигает высокой порядковой сходимости в первую очередь благодаря  интерполяции и экстраполяции градиентов в внутренней координаты представлении. Результаты нового алгоритма примененные к фосфата реакции переноса в протеинкиназе А будут представлены.

A-2: SL08 Крупнозернистая модель химической реакции КЗМХР (CGCRM): новый протокол для включения химических реакций в крупномасштабные МД симуляции
В. Я. Гаррисон * и Y.G. Аинглинг, Пенсильванский университет, химический факультет, 152 Дэви лаборатории,
University Park, PA 16802, США
Использование крупномасштабных молекулярной динамики (МД) компьютерных симуляций для моделирования сложных явлений повсеместны. Одной из нерешенных задач, однако, является включение химических реакций в МД модели  для существенной химии (since), в которой- (there are), в общем, не соответствующие потенциалы взаимодействия. Кроме того, есть (there are) ситуации, где (where) частицы в симуляции не представляют отдельные атомы, а группа атомов, как в приближении объединенного атома и концепция химически точного потенциала взаимодействия не существует (does not exist). Мы разработали новый и эффективный гибридный вычислительный подход к моделированию событий реакции, такие как фотон индуцированным разрыв связи и последующей абстракции и реакцией рекомбинации в крупных шкалах симуляций MD. Наше первое применение методологии- фотохимическая абляция (ablation) органических материалов.1 Типичное моделирование имеет 130000 молекул, то есть фактически около 1,5 М атомов, в 2x104 нм3 объема. Молекулы могут пройти 12 различных реакций в результате всего объема моделирования    в общей сложности 112000 химических реакций за время моделирования за 1 нс. Основные концептуальные результаты нашего моделирования  то, что фотохимические реакции  добавляют больше тепла к системе, чем только лазерное влияние. Временное и пространственное распределение тепла существенно отличается от закона распределения Беера (Beer`s). Эти изменения в теплоперенос обеспечивают основу для понимания экспериментальных наблюдений. Наша методология устанавливает протокол для моделирования химических реакций в самых различных процессах, включая фотохимических абляции биологических тканей и полимерных материалов, кооперативные эффекты реактивной бомбардировки атомарного кислорода и УФ-излучению, которая вредит объектам на низкой околоземной орбиты и радиации  индуцирующей события в воде.
1 Роль фотохимических фрагментации при лазерной абляции, Ю.Г. Аинглинг, НН Zhigilei и В. Д. Гаррисон,
Дж. фотохимии и фотобиологии: Химия, 145, 173-181 (2001); фотохимические индуцированных эффектов в материале
выброс в лазерной абляции, Y.G. Аинглинг и В. Д. Гаррисон, Chem. Phys. Lett., 364, 237-243 (2002).

A-2: SL09 От атомов до дендритов
Джей-Джей Хойт *, Sandia National Labs, Альбукерке, 87185, США; ВС Дэюнь и Марк Аста, Департамент материалы
Наука и техника, Северо-Западный Университет, Эванстон, Иллинойс, 60208, США;. Алена Карма, физический факультет,
Северо-восточный университет, Бостон, Массачусетс, 02115, США.

В сплошных или фазы поля моделировании дендритного затвердевания есть ряд свойств материалов, необходимых  как ввод, которые трудно, если вообще возможно,  получить из эксперимента. В данной работе мы рассмотрим Монте-Карло (МК) и молекулярной динамики (МД) методы моделирования недавно разработанных для извлечения межфазной свободной энергии, кинетических коэффициентов и малых направленных зависимостей каждого.  Межфазная свободная энергия получена путем мониторинга положения твердое тело-жидкость границы во время МД симуляций металлов поддержана на уровне  плавления, и это будет показано, что флуктуации техника способна вычислить анизотропию как низкую до 1%. Кроме того, результаты интерфейса скорости против переохлаждения будут сравнены с функционалом плотности основанным моделью кинетики кристаллизации по Михееву и Чернову.

A-2: SL10 Атомы микромагнетизма: нелинейные огрубления зёрен в магнетизме
В.В. Dobrovitski, Ames Laboratory, ГИП, Эймс, штат Айова, США

Многомасштабная явления, которые включают в себя несколько процессов, происходящих одновременно в разных масштабах длины, и обмена энергией друг с другом, являются широко распространенными в магнетизме (зарождение перемагничивания в атомного масштаба дефекта, влияние шероховатости поверхности на динамику доменной стенки). Покажем, что в многомасштабных
процессах, роль коротковолновых возбуждений динамически генерируемых вблизи дефектов имеет решающее значение, так что стандартная микромагнитная теория не является достаточной. Мы представляем новый нелинейный крупнозерновой  подход к масштабам длин связанный в динамическом магнитном моделировании, направленное на точную обработку микроскопических дефектов в наномагнетиках. Результаты моделирования проводились на модельных системах, где атомного масштаба изменения параметров представляют дефекты в реальных системах, показывают, что огрубление зерен достигает почти точности точных атомных моделирований, при описании системы с гораздо меньшим числом переменных.

A-2: SL12 ПРИМЕНЕНИя СВЯЗАННОЙ атомистической/дискретных- дислокаций модели
WA Кертин *, М. Дюваль, В. Шастри, Л. Shilkrot отдела технических наук, Университет Брауна, Providence, RI, США;
Р. Миллер, Инженерно-механический факультет, Университет Карлтон, Оттава, Канада
Для обработки различных масштабах одновременно, вычислительный метод был разработан в которой каждая дислокация рассматривается либо как атомистическая или континуума подразделение в рамках единой структуры, что позволяет описать каждую дислокацию перейти от атомистической в континуум, как это диктуется местными условиями. 1 Метод делит пространство
в атомистическом и континуума регионах, которые общаются поперек когерентной границы, обнаруживает дислокации как они приближаются к границе, и легко конвертирует их из одного описания к другому. В этой формулировке, атомистической регион может справиться с любой произвольной деформацией, которое происходит под действием приложенной загрузки в то время как континуум региона развивается в соответствии с дискретной пластичностью дислокации. Здесь, метод  распространен включить (I)  разъединенных атомистических регионов и (II) молекулярную динамику и динамику дислокаций, а не квазистатических решений. Применение метода для исследования хрупких и пластичных трещин ростущих в Al, Ni, и с водородом примесей, при конечных температурах затем представляются. Применение метода для исследования дислокаций скоплений при высоких углах зерен границ затем представлены. Эти примеры показывают возможности интегрированного многомасштабного моделирования для описания сложного механического явления в твердых телах. Наконец, прогресс по смежным многомасштабным моделям, которые включают  квантовую механику в атомистическом регионе, и которые подключают дискретные дислокации или примеси моделей в континуум кристалла, пластичность или диффузию, соответственно, сообщено.
1 л Shilkrot, Морская пехота Великобритании Миллер и В. А. Куртин, Дж. механика. Phys. Твердых тел, появляться (2004).


 A-2: L13 ЭКОЛОГИЧЕСКИ ЗАВИСИМЫХ ОБЛИГАЦИЙ- ПОРЯДКА (bond-order) потенциалов для переходных металлов И СПЛАВОВ: применение для дислокаций ПОВЕДЕНИЕ
Д. Нгуен Мань-*, ЕВРАТОМ / UKAEA Fusion ассоциации, Culham центр науки, Оксфордшир OX14 3DB,
Великобритания; М. Кавкуэлл, В. Vitek, Университет Пенсильвании, Филадельфия, Пенсильвания 19104-6267, США; DG Петтифор,
Департамент материалы, Оксфордский университет, Оксфорд OX1 3PH, Великобритания

Дан обзор последних событий надежной связью потенциалов облигаций-порядка (ПОП) (BOPs) для переходных металлов и их сплавов с SP-валентных элементов. Отличительной особенностью этих ПОП, что оба притяжения и отталкивания взносов к энергии связи составляют экологические зависимостей (ЭЗ).В первом случае это сканирование d-d облигаций S-валентными электронами, связанных с соседними атомами. Здесь показано, что эта проверка d-d связи интегралов, которые были получены аналитически в неортогональном сильной связи представлении, значительно расширяет возможности передачи BOPs и удаляет непоследовательность в силу расчета фононного расчетов
в bcc TM. ED, который появляется в отталкивающей части обязательной энергии имеет решающее значение для правильной оценки упругих модулей, и в частности для установки давления Коши. Построены BOPs были применены в целях предсказать деформации пути и структуры ядра дислокаций в bcc-Mo, L10-TiAl и fcc-Ir. В последнем случае, например, мы обнаружили, что энергия собственной ставки ошибок рассчитывается используя  BOPs (408 mJ/m2) является в прекрасном согласии как с экспериментом (420 mJ/m2) так  и AB initio расчетами  (365-445 mJ/m2). Ядерная структура винта и 60 градусов дислокаций в иридия были рассчитаны с помощью БОПС в сочетании с гибкой функцией  Грина граничных условий, которые позволяют обновления в самосогласованном пути  длинного ранга полей деформации  связанных с расслабленной дислокации конфигурацией.
Эта работа финансировалась совместно Великобритания инженерным и физическим научным исследованиям Совета и  ЕURATOM.

A-2: L14 Многомасштабное МОДЕЛИРОВАНИЕ двухслойной липидной мембраны
А. П. Любарцев, отдел физической химии, Аррениуса Lab., Стокгольмский университет, 106 91 Стокгольм, Швеция

Классической молекулярной динамики компьютерное моделирование в настоящее время может запустить для молекулярных систем, состоящих из
десяток тысяч атомов за время десятки наносекунд. Это все еще не достаточно для многих сложных, биологически и технологически важных систем, для которых мезомасштабные методы моделирования, с огрублением-зёрен всех- атомных
молекулярных моделей, обычно применяются. Это может быть довольно трудно установить потенциалы взаимодействия для крупнозернистых моделей. Идея многомасштабного подхода  получить эффективные потенциалы взаимодействия из атомистического моделирования меньший фрагмент изучаемой системы. Здесь многомасштабные подход применяется для моделирования из двухслойной липидной мембраны на мезоуровне. Во-первых, молекулярной динамики симуляции от первоначально неупорядоченной системы липидных молекул в воде были проведены и радиальных функций распределения между различными фрагментами липидов были определены. Тогда, крупнозернистая (десять участков) липидная модель была создана и обратная Монте-Карло
методика была применена для расчета эффективных потенциалов взаимодействия для этой модели, на основе распределения функции вычисленного на первом шаге. Наконец, некоторое симулирование грубого зерна модели на большем масштабе длины и времени были выполнены, как в Монте-Карло так и в молекулярной динамике: периодического образца молекул липидов заказаны в двухслойных; свободный лист таких двухслойных без периодических граничных условий; процесс самостоятельной сборки двухслойных из липидов случайно рассеянных в объеме.

A-2: L15 Многомасштабное моделирование динамики неуравновешенного (NON-EQULIBRIUM ) НАСЕЛЕНИЯ : плавная ИНТЕГРАЦИЯ Мезоскопических и макроскопических уровней описания
Леонард А. Харрис, Корнельский Университет, Факультет химических и биомолекулярных инженерия, Итака, штат Нью-Йорк 14853,
США

С приходом наноразмерных технологий обработки материалов и амбициозных усилий, предпринимаемых для модели биохимических цельноклеточной сетей, интерес быстро растет в развивающихся многомасштабных методах моделирования, которые могут включать стохастические эффекты шума присущие динамике популяций таких систем. Хотя многие попытки были сделаны недавно, специальные ad hoc  предположения  в основе многих из этих подходов и обширные вмешательства моделер (Мodeler), необходимых для осуществления их серьезно ограничивает их полезность. Мы приведем здесь новый подход к моделированию динамики неравновесного населения, который плавно и автоматически интегрирует мезоскопическое (т. е. дискретно-стохастическое) и макроскопическое (т.е. детерминированное) представления динамических
процессов и эффективно руководит системами через различные временные масштабы с минимальным вмешательством пользователя. Техника включает в себя идеи и Гибсона, и Брукса (Bruck`s ) следующей реакции метод и Жилеспи (Gillespie;s) тау-прыжок стратегии и представляет собой первый безручный (`hands-free`) подход к процедуре различных динамических событий в системе различных уровней описания одновременно в рамках одного моделирования.

A-2: L17 Диссипации энергии в МОДЕЛИРОВАНИи мезодинамики
Брэд Ли Holian * и Алехандро Страчан, Теоретический отдел в Лос-Аламосской национальной лаборатории в Лос-Аламосе,
NM 87545 (США)

Основы мезодинамики, применительно к поликристаллическим материалам, как металлы так и молекулярных кристаллов, представлены. Уравнения движения можно записать в гамильтоновой форме, которая обновляет координаты мезомасштаба точек массы, после чего их скорости, с учетом мезомасштабных сил получили от своих координат. Наметим минимальные требования для установления сил между частицами, основанные на поверхности склеивания и
требования макроскопического распространения звуковой волны. Там две возможные энергии- диссипативные стратегии мезочастиц движения: (1) скорость обновления могут включать Фирсова вязкого затухания  отношения к скорости
мезочастиц (mesoparticle;s) окрестности (получены путем усреднения по соседним точкам массы с соответствующей короткодействующей весовой функцией); (2) координировать обновления, а не с помощью  скорости мезочастиц, можно использовать  скорости окрестности, как это первоначально предлагалось Монаган в гладких частиц гидродинамике. Последний Монагана
подход может быть показан, что эквивалентен Фирсову затуханию, но несколько проще. Наконец, мы представляем новые подход к диссипативной передаче энергии, который применяются к степеням свободы, и температуры внутренней
мезомасштабных частиц.

A-2: L18 Диблок сополимеров для автомобильной промышленности: Мезоскопический ПОДХОД
А. Coslanich, М. Fermeglia *, М. и С. Ferrone Pricl, С.-какЛаборатории, Университет Триеста, Триест, Италия, Л. Мартинелли
и С. Sinesi, CRP-Fiat Group, Амаро (UD), Италия
В данной работе мы применили мезомасштабных подход моделирования для изучения морфологии равновесия линейного (AmBn) метакрилата диблок сополимера расплавов, представляющих особый интерес в автомобильной промышленности. Основная идея, что, в принципе, частичные химические структуры блока сополимера материалов могут быть отражены в наиболее фундаментальных и интересных путях от несовместимых эффектов. В частности, начиная с атомистически основанного моделирования мы получили процедуры 1) описывают в соответствующих модах полимерных цепей в терминах
соответствующих гауссовских моделей; 2) определить соответствующие взаимодействия Флори-Хаггинс параметров взаимодействия, 3) определить
шарик коэффициентов самодиффузии, необходимый для преобразования мезоскопически безразмерного шага времени на эффективный
масштаб времени.
A-2: L19 ЕДИНОЕ ОПИСАНИЕ искажения решетки ОТ атомного масштаба в континуум И ее применения к КМС (CMR) манганитов
K.H. Ан *, Т. Lookman, А. Саксена, и A.R. Епископ, MS-B262, Лос-Аламосской национальной лаборатории в Лос-Аламосе,
Нью-Мексико 87545, U.S.A.
Мы представляем первую атомную теорию масштаба искажения решетки использованием деформации-типа переменных и их ограничения
уравнений. Наш подход соединяет ограниченными атомного масштаба длины изменениями в континуум эластичности и описывает упругости при всех масштабах длин, который является центральным для понимания наноразмерной упругости и функциональных многомасштабных материалов. Мы применим его к атомному разрешению описания границ двойников, антифазных границ, и релаксации вокруг дефектов. Мы также расчитаем неоднородные электронные свойства, связанные с упругими текстурами, и обсудим деформацией индуцированные металл-диэлектрик сосуществования в колоссальных магниторезистивные (CMR) манганитов перовскита.

A-2: L20 Ab initio теории переноса заряда в органических кристаллах
К. Hannewald * и доверенность Bobbert, группа физики полимеров, Эйндховен лаборатории полимеров и полимерных Голландский
Институт, Технический Universiteit Eindhoven, PO Box 513, 5600 MB Эйндховен, Нидерланды

Мы представляем том теории переноса носителей заряда в органических молекулярных кристаллах высокой чистоты. Наш подход основан на оригинальной концепции Хольстейна (Holstein) малого полярона группы, но обобщенный по отношению к включению нелокальной электрон-фононной связи. В  этой модели Гольштейн- Пайерлса, получим явное выражение для подвижности в зависимости от температуры и продемонстрируем ее предсказательную силу, применив его к нафталину. Кристаллическая структура и фононный спектр вычисляются в теории функционала плотности. Электронный перевод интегралов получается из полной ab initio зонной структуры в модели сильной связи и электрон-фононных констант из изменений в наполненных интегралах переноса по искажению решетки. Наши первых принципов
результаты подвижности электронов и дырок показывают удивительно хорошее согласие с экспериментом и обеспечат новый взгляд на ряд до сих пор мало изученных таких явлений, как различия между электронами и дырками, своеобразные алгебраические зависимости температуры, и анизотропии эффекты

.А -3 Молекулярная динамика, Ланжевена Динамика и стохастический метод
А-3: IL01 (Ab initio) Изначальное  МОДЕЛИРОВАНИЕ ДИФФУЗИИ Во вне (OFF-) СТЕХИОМЕТРИЧЕСКОй ЖИДКОСТИ полупроводника
Джей-Джей , Derby * Е. Ко, М. Джейн, и JR Chelikowsky, Департамент химической технологии и материаловедения СО РАН
и Миннесота суперкомпьютерных институт, Университет Миннесоты, Миннеаполис, MN 55455, USA

Мы выделить результаты, полученные в симуляции квантово-механической молекулярной динамики в жидком состоянии нескольких соединений II-VI. Эти материалы используются в различных технологически важных электронных и оптико-электронных приборах. Мы стремимся получить более глубокое понимание поведения этих соединений в жидком состоянии, так что физические механизмы, ответственные за диффузию может быть выяснены. Наши моделирование использует псевдопотенциала плотности функционала метод ППФМ (PDFM) для расчета квантовых сил в расплаве. Мы готовим жидкости состояния ансамбль используя суперклетки и Ланжевена динамику для описания температур жидкости. Наши результаты иллюстрируют микроструктуры жидкого состояния и диффузии различных видов в расплаве. В частности, мы рассмотрели поведение вне стехиометрического состава из CdTe и тройного соединения CdZnTe.

А-3: L02 СМЕШАННая форсированная  AB INITIO  МОЛЕКУЛЯРНая ДИНАМИКа
Е. * Англада и Дж. М. Солер, Dpto. Физиков-де-ла Materia Condensada, Университет Aut;noma де Мадрид, 28049
Испания

Мы представляем новую методику, которая позволяет вести очень долго AB INITIO  молекулярной динамики симуляции. Мы используем простые силы (быстро оценить), которые периодически корректируется с самосогласованными, полными конвергентной плотности функциональными результатами. Простые силы могут быть получены с любым методом, но мы используем Харриса функционал с
минимального базиса набором . Эти силы будут исправлены периодически с самосогласованным, сходимыми функционала плотности расчетами. Мы считаем, что достаточно для выполнения этой поправки относительно редко, т. е. до каждые десять шагов или более, не меняя существенно статические или динамические средние, ни на самом деле свои траектории. Как упрощенная модель сил в сотни раз дешевле вычислить сходимые результаты, эти шаги виртуально свободны, и мы можем продлить время моделирования в десять раз. Метод особенно хорошо адаптирован к SIESTA, из-за его способности выполнять спектр функционала плотности расчёты, с очень быстрым , для очень точных, использованием той же методологии.

А-3: L03 О картах, кошках, и как моделировать идефинитный елонгациональный (IDEFINITE ELONGATIONAL) поток МОЛЕКУЛЯРНОЙ ДИНАМИКи
T.A. Охота и B.D. Тодд *, Центр молекулярной моделирование, Суинберн технологический университет, PO Box 218,
Хоторн, Виктория 3122, Австралия

На протяжении многих лет моделирование удлиненных (elongational или посленапряжённых extensional) потоков  симуляциями молекулярной динамики считалось невозможным из-за ограничений, что моделирование должно быть прекращено как только длина моделирования варианта  в оговоренное разрешение равна дважды потенциала взаимодействия радиусу. Проблема всегда была, что неравновесные устойчивого состояния (steady-state) могут никогда (Ilnever) быть достигнуты для молекулярных систем, так как их времена релаксации значительно больше, чем отметки (lime) принятые для этого минимального расширения  будут  достигнуты. Это ограничение было снято в 1998 когда  было показано1-3, как удалить эту отметку ограничение по использованию новых периодических граничных условий, сперва разработано Крайник и Reinelt4 в своих исследованиях пен. Тем не менее, вывод Крайника и Reinelt  алгебраически участвует и не али (ali), чему легко следовать. В этой статье мы покажем, как значительно упростить вывод с использованием теории динамических систем. В частности, мы покажем, что знаменитая «Кошкина карта» (cat MAP), разработанный Arnold5, может быть использована  как периодические граничные условия для молекулярной динамики симуляций плоского елонгационного потока. Использование формализм динамической теории систем можно вычислить необходимые параметры этих периодических граничных условий в некоторых линий (severallines) алгебры,  сравнивая с страницами алгебры, участвующих в оригинальном выводе. Мы также представляем некоторые данные моделирования для линейных полимерных расплавов переживающие плоских удлинения и продемонстрируем, как полезны эти периодические граничные условия при исследовании полимеров реологии.
1. Тодд, B.D. и Daivis, P.J., 1998, Phys. Преподобный Lett., 81, 1118
2. Тодд, B.D. и Daivis, P.J., 1999, Computo Phys. Commun., 117, 191
3. Барания, А. и Каммингс, физическая подготовка, 1999, J. Chem. Phys., 110,42
4. Крайник, А.М. и Reinelt, D.A., 1992, Int. Дж. многофазного потока. 18, 1045
5. Арнольд В.И. и Авез, А., 1968, Эргодические проблемы с / assical механики (Бенджамин, Нью-Йорк)

А-3: L04 НОВАЯ МОДЕЛЬ Для моделирования КОЛЛОИДНой ДИНАМИКи
В. * Lobaskin и В. Duenweg, Института Макса Планка для полимерных исследований, Майнц, D-55128, Германия

Мы представляем новую гибридной решетки-Больцмана и Ланжевена молекулярной динамики схему для моделирования динамики суспензий сферических коллоидных частиц. Растворитель моделируется на уровне метода решетки- Больцмана в то время как молекулярная динамика делается для растворенного вещества. Связи между двумя осуществляется через силу трения, действующей как на растворитель так и на растворенное вещество, которая зависит от относительной скорости. Сферические коллоидные частицы представляется взаимодействием сайтов на ее поверхности. Покажем, что эта схема количественно воспроизводит поступательной и вращательной диффузии нейтральных сферических частиц в жидкости и анализ свойств самодиффузии заряженных частиц в зависимости от заряда.

А-3: L05 МОЛЕКУЛЯРНое МОДЕЛИРОВАНИЕ ДИФФУЗИИ В белковых кристаллах
Курош Малек *, Марк-Оливье Коппенс, физической химии и молекулярной термодинамики, Делфт Chem Tech,
Технологический университет Делфта Julianalaan 136, 2628 BL, Нидерланды

Накрест- соединенные белковые кристаллы (CLPC) являются кристаллиновыми микро-или мезопористыми материалами с одинакового размера пор распределением, что фиксируется расположением их элементарных ячеек. Белковые молекулы связаны друг с другом в трехмерной решетке с упорядоченными микроскопическими каналами между ними в диапазоне от 2 до 10 нанометров. Как в кристаллах цеолита, понимание природы молекулярного и ионного транспорта в белковых кристаллов  важно, например, для установления способности молекул белка связывать лигандами, для разделения смесей или катализатора (био-) реакций в кристаллах. Мы моделировали диффузию сферического, незаряженного или заряженного зонда в различных морфологиях накрест-соединенного лисозима кристалла. Хотя мы ориентируемся на лисозима, методология и результаты могут быть легко расширены для широкого круга кристаллов протеинов. Таким образом, наши результаты моделирования приносят новый взгляд на диффузию в кристаллы белка и биологических каналов в более общем смысле.

A-3: SL06 МОДЕЛИРОВАНИЕ дендримеров и сверхразветвленных полимеров
D.B. Адольф, И. М. * Неелов и G.R. Дэвис, IRC в полимерной науки и техники, Университет Лидса, школа
физики и астрономии, Leeds, LS2 9JT, Великобритания

Сильно разветвленных молекулы, таких как дендримеры, обладают полностью разветвленными, фокуснополыми древовидными структурами в то время как их
сверхразветвленные  родственники содержат смесь разветвленных и неразветвленных участков и, следовательно, как правило, не имеют
симметричной топологии. Эксперимент и моделирование показали, эти материалы могут обладать собственным сдвигом вязкости, что пики с молекулярным весом, а не один, что постоянно увеличиваются с молекулярной массой, как иллюстрируется линейными цепями. Приложения в супрамолекулярной химии, доставки лекарств и других приложений гость-хозяин бейв (bave) мотивированные дальнейший интерес в этих молекулах в тернс (terrns)  их размера, формы и интерьера профилей плотности. Это обсуждение будет суммировать текущее  вычислительное исследование дендримеров и сверхразветвленных полимеров под сдвигом и удлиненным потоком. Методика обслуживает броуновскую динамику в присутствии исключенного объема и гидродинамических взаимодействий. Поведение различных статистических и реологических величин будет представлено в том числе их зависимость от степени и распределения разветвленных сайтов в дендритные молекулы.