Варианты раскладки кодонов на шахматной доске

Представим проблему размещения кодонов в Матрице 8х8 графически.
Не претендуя ни на полноту, ни на законченность.
Так сказать в порядке "рабочего предположения о".

Сначала разберёмся с вопросом «в целом».
Двадцать аминокислот продуцируются триплетами из четырех азотистых оснований – Боже, до чего же «заумно» я говорю! -  и встаёт вопрос о «правильной» форме их представления.

Итак перечислим все двадцать аминокислот и число кодонов их продуцирующих.

Метионин - 1
Триптофан - 1
Аспарагин - 2
Аспарагиновая кислота - 2
Гистидин - 2
Глутамин - 2
Глутаминовая кислота - 2
Лизин - 2
Тирозин - 2
Фенил-аланин - 2
Цистеин - 2
Изолейцин - 3
Аланин - 4
Валин - 4
Глицин - 4
Пролин - 4
Треонин - 4
Аргинин - 6
Лейцин - 6
Серин – 6

То есть мы имеем:
3 случая по 6 кодонов,
5 случаев по 4 кодона.
Один случай по 3 кодона и примыкающий к нему случай трёх стоп-кодонов.
Девять случаев по 2 кодона.
И два случая по одному кодону, включая сюда и старт-кодон.

Посмотрим на вариант возможного размещения всех вариантов на шахматной доске.

На иллюстрации они представлены различными цветами.
Легко видеть, что всё достаточно симметрично!


Рецензии