StatCovid. Новый злобный лямбда-штамм

Размышления | Новый злобный лямбда-штамм. Теория и практика

• "Московский комсомолец" (03.08.2021): << На Россию надвигается новый штамм: Лямбда обещает стать самой смертоносной... Ученые подозревают, что наиболее опасен как раз вариант Лямбда. Сегодня Лямбда успешно вытесняет Гамму (бывший бразильский штамм) в Латинской Америке. Лямбда распространяется преимущественно в странах Южной Америки, включая Чили, Перу, Аргентину и Эквадор... В опубликованной на днях научной работе за авторством молекулярного биолога и биотехнолога из Университета Мадраса (Индия), доктора Прийома Бозе отмечается, что Лямбда-вариант SARS-CoV-2 демонстрирует более высокую инфекционность и иммунную устойчивость... Важнейшими вирусологическими особенности варианта Лямбда доктор Бозе считает устойчивость к антителам (так, для нейтрализации вируса требуется в полтора раза больше антител, чем для нейтрализации его предшественника из Уханя) и увеличение скорости передачи вируса. >>

• Deutsche Welle Russian (06.08.2021): << Согласно японскому исследованию, лямбда-вариант коронавируса из Южной Америки не только более заразен, но и более устойчив к антителам, чем все прочие. Пора ли начинать его бояться? По мнению японской исследовательской группы, лямбда-вариант отвечает всем критериям, чтобы внести его в список  "вызывающих беспокойство". Авторы призывают ВОЗ изменить классификацию лямбда-варианта, аргументируя это тем, что он соответствует всем требованиям для этого: обладает повышенной контагиозностью и устойчивостью к антителам - как и обнаруженный в Индии дельта-вариант, который ВОЗ классифицирует как "вызывающий беспокойство". >>

—

Попробуем очередную штаммную страшилку-обеспокоенность поверить практикой. Есть готовый полигон, где лямбда-штамм уже успел наследить. Южная Америка. Там и посмотрим.

Будем использовать данные информационного центра OWID (Оксфорд, Великобритания).

Лямбда-штамм. Сначала появился в популяции в Перу (04.01.2021): 2,3% от всего спектра штаммов (выборочное секвенирование генома).

Локальные максимумы лямбда-штамма в Южной Америке (2021):
• Перу (17.05): 97%
• Чили (17.05): 38%
• Аргентина (31.05): 17%
• Эквадор (28.06): 17%

Для информации. В Перу расклад по вакцинам на конец мая 2021: американская Pfizer (69%), китайская Sinopharm (17%) и английская AstraZeneca (14%). В Чили — 93% привиты вакциной CoronaVac (Sinovac, Китай). Остальные Pfizer.

Итак, нас интересует заразность лямбда-штамма. Значит, надо смотреть заболеваемость.

Смотрим. Пик для Перу — 13.04 (301 случай на 1 млн жителей). Затем началось медленное снижение. Уровень 100 был к 13.06. Спуск продолжился до локального минимума — 39 (29.07).

Для Аргентины локальный максимум (24.05) — 715. Причем уровень 300 она прошла в начале апреля 2021 и только в конце июля вернулась к этому значению. А в Аргентине в этот период доминирует гамма-штамм (51%). Выходит, что он куда более заразный, нежели лямбда.

Да и Бразилия по заболеваемости явно выше Перу на этом отрезке времени. А там гамма-штамм был выше 95%.

Не сходится с заболеваемостью.

Теперь смертность.

Смертность (количество смертей к популяции) в Перу достигла пика 23.04 (265,1 на 100 тыс. жителей). Т.е. в теории это может быть вызвано лямбда-штаммом. Но уже к 22.05 стало 152,8. Резкое падение смертности далее продолжилось.

Не надо забывать, что смертность имеет инерционность минимум в 2 недели относительно выявления.  Смотрим заболеваемость на 08.05 — 198 (на 1 млн). Так что смертность стала резко снижаться почти на пике заболеваемости (с  полной доминацией лямбда-штамма).

Опять не сходится.

Так, может, дело в вакцинах? И пора бы уже предметно изучать по срокам и партиям поставок их долю на том или ином участке эпидемического процесса в каждой конкретной стране?