О частице НЕ в сложноподчиненном предложении

ВОПРОС
Вопрос о силе нельзя сводить к ее количеству. Важно не только(,) сколько ее пришло, но и куда она пошла, что стала питать, где встретила узкие места.
Важно не только [это], но и [это]. На месте первого [это] стоит придаточное предложение, и вроде бы запятая должна быть. Второе [это] включает три придаточных, но запятую перед первым из них не поставишь. Почему так? А может, и первая запятая не нужна?

ОТВЕТ 
Запятая действительно не нужна, что объясняется наличием частицы НЕ, причем частица ТОЛЬКО не влияет на решение, что видно из правил Розенталя. Там же приведен пример предложения с двойным союзом НЕ ТОЛЬКО...НО И.

В этом случае придаточные фактически приравниваются к ЧЛЕНАМ предложения, сравнить: Важно не только количество, но и качество работы. На место членов предложения мы ставим придаточное или ряд придаточных.

Розенталь § 33. Запятая между главной и придаточной частями сложноподчиненного предложения. http://old-rozental.ru/punctuatio.php?sid=137

4. Между главной и следующей за ней придаточной частью сложноподчиненного предложения запятая не ставится:
(1) В море, в качке, спишь не когда хочешь, а когда можешь (Гонч.); Попытайтесь выяснить не что они уже сделали, а что они собираются ещё сделать; Я пришёл не чтобы мешать вам в работе, а, наоборот, чтобы помочь; Римские полководцы считали важным установить не сколько войск противника перед ними, а где они; Он знает не только где водится дичь, но и какие её разновидности там обитают;

6. Если перед подчинительным союзом стоят усилительные частицы как раз, только, лишь, исключительно и т. п., то перед ними ставится запятая (вопреки интонации, так как при чтении пауза перед ними не делается): Катя вышла из столовой, как раз когда мы шагнули друг к другу через какие-то чемоданы (Кав.); Я эту работу выполню, только если буду свободен (ср.: …если только буду свободен); Он приехал, исключительно чтобы помочь мне (ср.: Он приехал не только чтобы повидаться со мной, но и чтобы оказать мне помощь — влияние отрицательной частицы не).

Возможное редактирование:
Вопрос о силе нельзя сводить к ее количеству. Здесь важен не только числовой показатель, но и куда она пошла, что стала питать, где встретила узкие места.

А вот Нацкорпус, и здесь решение на любой вкус:
Дмитрий Карцев. Самый нужный бизнес // «Русский репортер», 2013
Наконец, это показатели занятости населения (наиболее простой критерий) и уровня трудовых доходов — не только сколько народу занято в бизнесе, но и насколько хороши условия этой работы.
А. А. Ивин. По законам логики (1983)
Чтобы решить, относится кто-то к среднему возрасту, надо знать не только, сколько ему лет, но и то, в какую эпоху он жил.

Но все же отметим следующее. Оборот "не только сколько" используется не часто (для произношения он не очень удобен), а запятую ставили обычно в прежней орфографии. По грамматике и по правилам Розенталя она все же не нужна, учитывая приведенный им пример.  Также запятой мы отделяем частицу "только" от союзного слова "сколько", к которому она относится, а это неверно.