Версия по теории русловых названий(ТРН).
Город Томск назван по реке Томь, на которой он расположен. Река Томь, как и многие сибирские реки, очень извилиста в устье, а также изменчива, судя по "наплывам" старого русла. Сложно называть такую реку по форме устья, как было принято у русских. Поэтому, река названа по характерному месту "стабильного" русла, а именно там, где и находится город Томск. Характерное место русла Томи, это две излучины реки в городе, в виде буквы "М".
То-мь- буквально "это есть (буква)М".
Похожие условия названия в городе Тюмень, статья http://proza.ru/2025/04/01/1558.
Похожее название имеет река Мста, статья http://proza.ru/2025/03/10/125.
Буква алфавита используется в названии города Тверь(Т-твердь) http://proza.ru/2025/02/28/1716, Т-образное соединение Волги и Тверицы, город Кстово http://proza.ru/2025/03/12/1693, река Оять http://proza.ru/2025/03/20/820, река Омь(Омск) http://proza.ru/2025/04/15/1794, река Уводь(Иваново) http://proza.ru/2025/04/14/1446, река Донхава(Конаково) http://proza.ru/2025/03/05/1188, река Лопань (Л и О), Харьков http://proza.ru/2025/03/10/1460.
Город Ярославль, река Которосль(Л и Я) http://proza.ru/2025/04/17/1003.
Река Яна http://proza.ru/2025/04/27/1688, река Нея http://proza.ru/2025/05/05/1397. Город Малоярославец http://proza.ru/2025/05/04/453.
Есть даже пример названия с арабской вязью, это город Вязьма http://proza.ru/2025/03/22/1897.
Самое длинное буквенное русловое название, на данный момент, это река Смотрич, Украина http://proza.ru/2025/06/20/1016.
Дополнение: собранный материал позволяет сделать уточнение по названию реки. Окончание "мь" это сокращённое слово "ма-ть". Есть разница в названиях рек с окончанием "ма" и "мь", которая выражается в том, что названия рек с "мь" могут иметь остров в устье, как образ реки, которая "родила землю", по аналогии с женщиной. В данном случае "ма" это "мать Земля" или просто "земля", "это место". Слог "мь"(ма-ть) добавляет "действие"(ть, тать), то есть "рождение". Поэтому река называется не То-ма, а То-мь.